Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMCC3Q9ULS5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCC3Q9ULS5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms