Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA8BQ9ULN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8BQ9ULN7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms