Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms