Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC9Q9UKV0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms