Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C4Q9UKN8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C4Q9UKN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms