Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTBP2Q9UKA9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms