Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNMT3LQ9UJW3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNMT3LQ9UJW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms