Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBK1Q9UHD2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBK1Q9UHD2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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