Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5BQ9UGL1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5BQ9UGL1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5BQ9UGL1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms