Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRF1LQ9UGC7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms