Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms