Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPS7AQ9UBW8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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