Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms