Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms