Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACD3Q9P035 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HACD3Q9P035 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms