Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNK4Q9NYG8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNK4Q9NYG8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms