Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX43Q9NXZ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX43Q9NXZ2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms