Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMPD4Q9NXE4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPD4Q9NXE4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms