Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH5Q9NX47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms