Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC28Q9NX36 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC28Q9NX36 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms