Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDHAF2Q9NX18 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms