Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2orf42Q9NWW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2orf42Q9NWW7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms