Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM140Q9NV12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms