Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCP11L1Q9NUJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCP11L1Q9NUJ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms