Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SERINC1Q9NRX5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1273.5 ms