Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM1Q9NRU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM1Q9NRU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms