Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTPS2Q9NRF8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTPS2Q9NRF8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms