Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXO8Q9NRD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXO8Q9NRD0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms