Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPHK2Q9NRA0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPHK2Q9NRA0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms