Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF3Q9NR23 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms