Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms