Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN4Q9NQP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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