Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA4BQ9NPR2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA4BQ9NPR2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms