Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MED4Q9NPJ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED4Q9NPJ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED4Q9NPJ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms