Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XAB2Q9HCS7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XAB2Q9HCS7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms