Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L4AQ9HCS5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L4AQ9HCS5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L4AQ9HCS5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms