Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4F12Q9HCS2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4F12Q9HCS2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms