Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POPDC2Q9HBU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POPDC2Q9HBU9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms