Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM27Q9HBJ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms