Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TDRD3Q9H7E2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TDRD3Q9H7E2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TDRD3Q9H7E2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms