Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCAS3Q9H6U6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCAS3Q9H6U6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms