Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RETREG1Q9H6L5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RETREG1Q9H6L5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms