Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C11orf49Q9H6J7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf49Q9H6J7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf49Q9H6J7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms