Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
STN1Q9H668 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
STN1Q9H668 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms