Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1DQ9H5J8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF1DQ9H5J8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms