Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRABDQ9H4I3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABDQ9H4I3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms