Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00597Q9H2U6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00597Q9H2U6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms