Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB6CQ9H0N0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB6CQ9H0N0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms