Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKRN2Q9H000 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms