Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM39BQ9GZU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM39BQ9GZU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms